L’établissement est dirigé par un directeur général ainsi qu’un directeur délégué nommés par le Ministère de la santé et des solidarités. Leur rôle est d’assurer la gestion administrative, financière et technique de l’établissement. Ils exécutent les décisions du Conseil d’Administration.
Le Conseil d’Administration, instance décisionnelle, définit la politique générale de l’établissement et délibère sur différents points. Il est présidé par un Conseiller Départemental de l’Isère. Il se réunit au moins quatre fois par an.